Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMC5Q6UXY8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMC5Q6UXY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMC5Q6UXY8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms