Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRAIDQ6UW56 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms