Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOA5Q6Q788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOA5Q6Q788 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOA5Q6Q788 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms