Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLC25A47Q6Q0C1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC25A47Q6Q0C1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC25A47Q6Q0C1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC25A47Q6Q0C1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC25A47Q6Q0C1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC25A47Q6Q0C1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms