Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC23A3Q6PIS1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC23A3Q6PIS1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms