Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL35Q6PF15 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL35Q6PF15 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL35Q6PF15 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms