Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RWDD4Q6NW29 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms