Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUJ1

PSAPL1, Proactivator polypeptide-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSAPL1Q6NUJ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSAPL1Q6NUJ1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSAPL1Q6NUJ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSAPL1Q6NUJ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms