Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD2Q6NTF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHBDD2Q6NTF9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHBDD2Q6NTF9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms