Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMBOX1Q6NT76 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMBOX1Q6NT76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMBOX1Q6NT76 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms