Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDE2Q6IQ49 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SDE2Q6IQ49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms