Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD7BQ6GQQ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUD7BQ6GQQ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUD7BQ6GQQ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUD7BQ6GQQ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
OTUD7BQ6GQQ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD7BQ6GQQ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD7BQ6GQQ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD7BQ6GQQ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD7BQ6GQQ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms