Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTRHD1Q6GMV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTRHD1Q6GMV3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTRHD1Q6GMV3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTRHD1Q6GMV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTRHD1Q6GMV3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms