Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CARMIL2Q6F5E8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CARMIL2Q6F5E8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CARMIL2Q6F5E8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms