Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCTD16Q68DU8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCTD16Q68DU8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms