Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GGNBP1Q5YKI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GGNBP1Q5YKI7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GGNBP1Q5YKI7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms