Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BROXQ5VW32 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BROXQ5VW32 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms