Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR78Q5VTH9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR78Q5VTH9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR78Q5VTH9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR78Q5VTH9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms