Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
MAGI3Q5TCQ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MAGI3Q5TCQ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
MAGI3Q5TCQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAGI3Q5TCQ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAGI3Q5TCQ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAGI3Q5TCQ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
MAGI3Q5TCQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
MAGI3Q5TCQ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms