Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRIF1Q5T3J3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRIF1Q5T3J3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRIF1Q5T3J3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms