Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C6orf141Q5SZD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C6orf141Q5SZD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms