Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP170Q5SW79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CEP170Q5SW79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
CEP170Q5SW79 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
CEP170Q5SW79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms