Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SAPCD1Q5SSQ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SAPCD1Q5SSQ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SAPCD1Q5SSQ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms