Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP188Q5SRE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUP188Q5SRE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NUP188Q5SRE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms