Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPANXN3Q5MJ09 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPANXN3Q5MJ09 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPANXN3Q5MJ09 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms