Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIA3Q5JRA6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MIA3Q5JRA6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MIA3Q5JRA6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms