Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
RTL5Q5HYW3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RTL5Q5HYW3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RTL5Q5HYW3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms