Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM61Q5EBN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM61Q5EBN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM61Q5EBN2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms