Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL22Q53GT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL22Q53GT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms