Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNAL1Q4LDG9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAL1Q4LDG9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAL1Q4LDG9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1132.6 ms