Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRY2Q49AN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRY2Q49AN0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRY2Q49AN0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CRY2Q49AN0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms