Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GNPTABQ3T906 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GNPTABQ3T906 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GNPTABQ3T906 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms