Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-BQ31612 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-BQ31612 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms