Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC57Q2TAC2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC57Q2TAC2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC57Q2TAC2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC57Q2TAC2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms