Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTC1Q2NKJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTC1Q2NKJ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms