Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC96Q2M329 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC96Q2M329 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC96Q2M329 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms