Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STX1AQ16623 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX1AQ16623 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms