Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGCAQ16586 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCAQ16586 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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SGCAQ16586 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCAQ16586 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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