Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRA6Q16445 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRA6Q16445 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms