Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HMGN3Q15651 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms