Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC9A3R2Q15599 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC9A3R2Q15599 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC9A3R2Q15599 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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