Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR6A1Q15406 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR6A1Q15406 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR6A1Q15406 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms