Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAB3GAP1Q15042 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RAB3GAP1Q15042 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RAB3GAP1Q15042 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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