Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TNIP1Q15025 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNIP1Q15025 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNIP1Q15025 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNIP1Q15025 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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