Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSME4Q14997 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSME4Q14997 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSME4Q14997 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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