Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GPNMBQ14956 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPNMBQ14956 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPNMBQ14956 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPNMBQ14956 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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