Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HNF4GQ14541 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HNF4GQ14541 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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