Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53BQ14153 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM53BQ14153 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53BQ14153 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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