Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCARB2Q14108 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCARB2Q14108 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCARB2Q14108 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms