Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CDK13Q14004 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CDK13Q14004 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CDK13Q14004 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CDK13Q14004 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
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